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《科技期刊动态监测快报》2023年第3期
服务领域: 科技期刊发展智库
创建时间: 2023-03-01
情报产品: 科技期刊动态监测快报
编译团队: 编辑出版部

1、研究人员推动预印本审查以改善科学交流

  加州大学旧金山分校(the University of California, San Francisco, 简称UCSF)的结构生物学家James Fraser表示,他已经多年没有为期刊审理过稿件。相反,James Fraser和他的实验室成员专注于审查预印本研究,这些研究皆是作者绕过期刊的同行评议过程在网上发布的文章。

  James Fraser认为,与传统的基于期刊的同行评议相比,预印本的审查具有很大的优势。作者可以更快地获得专家反馈,这些反馈可以来自更大、更多样化的审稿人群体。这个过程也具有效率:审稿人可以只关注科学研究的质量,而不必担心论文是否适合特定的期刊。对文章进行的评论也可以与所有人共享,而不再仅仅局限于作者和编辑群体。James Fraser指出,“这(评审意见)是有价值的东西,但在传统的审查过程中经常被锁定”,因为大多数期刊对评审意见都是保密的。

  预印本审查代表着学术交流的根本性转变,James Fraser并不是唯一一个看到预印本审查前景的人,一些学者认为预印本审查对期刊来说是有价值的输入,希望在未来,经评议后的预印本最终可以取代期刊出版物。

2、应用程序PIXLS使预印本更易于用作信息来源

  2023 年 1 月,德国生命科学信息中心(Informationszentrum Lebenswissenschaften, ZB MED)发文称,由Philipp Schaer教授领导的TH K?ln工作组和由Konrad F?rstner教授领导的ZB MED工作组,将在未来三年内开发一个应用程序PIXLS,用于自动打开预印本服务器。该项目由德国研究基金会(Die Deutsche Forschungsgemeinschaft , 简称DFG )资助。

  PIXLS系统地开放了预印本服务器上以前被忽视的信息来源,并通过增值服务使其更易于访问,这样可以更轻松地对全文和元数据进行再利用。PIXLS团队依赖于信息提取管道,该应用程序从预印本的非结构化数据(即连续文本或数字)中提取结构化信息,数据库可以更好地处理此类结构化信息。因此,它们可以以多种方式重用,也更容易找到。

  提取的数据会在 ZB MED 知识环境中合并和标准化——ZB MED 已经开发的数据库,然后,该数据库将开发增值服务使它们可用于研究。例如,开放数据接口或声誉和趋势指标。这些数据也将通过 ZB MED 的发现服务 LIVIVO 提供。本着开放科学的精神,数据和技术都可供图书馆和科学界重复使用。

  相关背景:德国生命科学信息中心,是生命科学数据和信息的德国国家基础设施和研究中心。目标是为全国提供医学、保健、营养、环境和农业科学及其基础科学和外围领域的信息和文献,以满足研究、教学和实践的需要。

3、对比medRxiv预印本与同行评议期刊文章报告的临床研究结果

  预印本虽已被广泛采用来加强科学领域研究的传播,但公众仍担忧通过预印本获得的医学研究有可能导致误导性传播。JAMA Netw Open在2022年12月发布的Comparison of Clinical Study Results Reported in medRxiv Preprints vs Peer-reviewed Journal Articles一文中,Guneet Janda等人评估了2020年9月发布在medRxiv上,同时截止至2022年9月15日前发表在同行评议期刊上的临床研究类预印本,通过对发表在medRxiv和期刊上文章的样本量、结果和结论进行比较,发现在2020年9月首次发布在medRxiv上的1399篇预印本中,截至2022年9月15日,共有1077篇(77.0%)已经正式发表,发表时间中位数为预印本发布后6个月(IQR,3-8个月)。

  在描述临床试验、观察性研究或元分析的547个预印本-期刊文章对中,293个(53.6%)与COVID-19有关,其中534对(97.6%)的结果一致,13对(2.4%)不一致。在涉及研究样本量的535个预印本-期刊文章对中,462对(86.4%)样本量是一致的;在样本量不一致的73对样本中,有43对(58.9%)在期刊发表中的样本较大,此外434对(81.1%)数据分析有一致的结果;101对不一致的结果中有66对(65.3%)的效应估计值方向相同,在统计上是一致的。总体而言,526对预印本和期刊论文(96.2%)的研究解释是一致的。因此可以得出,大多数临床研究作为预印本发表在medRxiv上,随后发表在同行评议的期刊上,具有一致的研究特征、结果和结论。超过四分之三的预印本在24个月内发表在期刊上,这些结果可能表明许多预印本报告的发现与最终的同行评议出版物一致。

4、学生对谷歌中发现的预印本的看法:识别和评估的窗口

  预印本在学术交流中发挥着重要作用。College & Research Libraries (C&RL)在2023年第1期发表的文章Students’ Perceptions of Preprints Discovered in Google: A Window into Recognition And Evaluation中,Tara Tobin Cataldo等以使用模拟谷歌环境的学生为研究对象,调查学生对预印本的认知情况。研究数据来源于116名高中、社区大学的本科及研究生,重点关注预印本的有用性、可信度和识别性。研究结果显示,是否带有“预印本”或“同行评议”的标签在帮助学生判断文章有用性或可引用性方面几乎没有差别,但“同行评议”标签在判断可信度方面发挥了作用。此外,大多数学生不认为这些资源是预印本,而对标签或提示等的熟悉程度以及它们之间的关联方式会影响是否以及如何使用它们。该研究最后建议,需要一种更具协作性的方法来使预印本更容易被识别和理解。鉴于预印本服务器作为公开可用的科学信息来源的重要性,出版商、学者、图书馆员、记者和教师应共同努力,确保采用标准化、通用的方法。

5、管理通用知识库和机构知识库中预印本的十大推荐做法

2022年12月12日,开放获取和知识库联盟(Confederation of Open Access Repository,简称COAR) 和 生物科学和出版促进会(Accelerating Science and Publication in biology,简称ASAPbio)宣布发布“管理通用知识库和机构知识库中预印本的十大推荐做法”。随着预印本共享变得越来越普遍,当前急需一个有凝聚力和可持续发展的生态系统来支持世界各地的研究人员。部分作者会选择将他们的研究成果存放到机构或通用知识库中,但预印本存储面临的问题包括:许多预印本服务器只允许提交英文作品、预印本服务器的长期资助问题悬而未决等,这些问题无疑会阻碍预印本传播的广泛性和持续性。因此,COAR 和ASAPbio的预印本工作组确定了十项推荐的预印本管理实践做法,其中涉及预印本的链接、发现和编辑过程。具体如下:

1.在提交过程中为作者提供一个选项,以提供有关其他预印本、已接受手稿、已发表版本和外部同行评议的信息;

2.当此信息可用时,使用“dc:relation”字段或“isIdenticalTo”、“isVersionOf”、“isPreprintOf”或“hasReview”指示知识库元数据记录中有相关内容,并包含外部资源的 PID;

3.当信息可用时,在预印本登录页面上链接相关版本和外部同行评议;

4.为知识库中预印本的每个新版本分配一个唯一的 PID 并包含一个版本号,该版本号代表其更新顺序;

5.除了版本和评论之外,使作者能够链接到其他相关资源,例如数据、代码或其他相关输出;

6.确保预印本被纳入到领域的预印本发现和索引系统中;

7.在元数据记录和登录页上明确指出该文档是预印本、工作文件或其他特定术语;

8.在预印本的内容页上包含一个文本横幅,告知读者该文档是预印本;

9.在登陆页面或知识库网站上清楚地表明对预印本应用了哪种类型的审核或筛选流程;

10.如果预印本已被删除,请保留元数据和将其状态指定为“撤回”的登陆页面。

6、 PLOS和EarthArXiv预印本平台之间的集成系统现已上线

  PLOS 是一家非营利性开放获取出版商,通过引领研究交流的变革,使研究人员能够加速科学和医学的进步。PLOS推动了 OA 替代订阅期刊的运动,建立了第一个包含所有研究的多学科出版物PLOS ONE,它重新定义了科学期刊。从2023年1月31日开始,向PLOS Climate,PLOS Sustainability and Transformation和PLOS Water提交作品的作者可选择直接提交系统并自动将其手稿转发到 EarthArXiv 预印本服务器。在投稿过程中,作者将说明他们的稿件是否已作为预印本发布。如果有,PLOS会要求提供DOI。如果没有,作者可以选择加入此新服务。EarthArXiv 收到后,将对每份手稿进行适用性筛选,包括检查范围、适当性和潜在的双重用途研究。大多数预印本将在一周内发布在平台上。

7、预印本:科学出版物的游戏规则改变者?

  European Heart Journal 2023年1月发表的文章Preprints: a game changer in scientific publications? 认为,数字时代推动了医学和科学信息的传播,互联网赢得了对传统期刊的优先权和排他性的竞争,预印本已经成为传播科学进步的手段,代表了科学过程中的重大范式转变。文章指出,尽管医学界最初非常谨慎,但预印本逐渐获得医学关注,有些甚至比相应的同行评议文章获得更多引用。但预印本和传统期刊一样也面临着发布后撤回的问题,且不同预印本服务器执行的要求和质量标准差异很大。本研究表明,预印本未来将继续存在,然而,预印本只有在可信的情况下才能加速科学发现。现在科学出版正面临一个关键时刻,编辑工作应该集中精力从预印本提供的独特机会中获益,与此同时,也要提高预印本的质量以克服它们当前的局限性。文章最后建议,国际公认的利益相关者,包括世界卫生组织,应该发布预印本建议,以促进在服务器中报告与发布预印本所需的质量标准达成共识。

8、利用开源应用部署预印本服务器和在线期刊作为校园研究管理系统

  2023年1月,邦阿西南州立大学的Randy Joy Magno Ventayen在SSRN发表Deployment of Preprint Servers and Online Journals as Campus Research Management System using Open-Source Applications一文,分享了在使用开源应用程序部署预印本服务器和在线期刊作为校园研究管理系统方面的经验。该研究设计了一个使用开源代码的预印本管理应用程序作为该校预印本数据管理的门户(图1)。该预印本服务器于2021年安装,服务器主页使用PKP的开源应用程序开发,可显示最新的预印本,并不定期更新。同时绘制了学校预印本(图2)和后印本(图3)的出版流程,供该校师生参考。

  研究最后认为,研究管理是大学在研究中发挥作用的必要条件,在开源应用程序的帮助下,邦阿西南州立大学林加延校区的研究管理系统中安装了预印本和后印本门户,它是学校师生发表研究成果的平台。该研究结果还表明,从研究人员的角度来看,门户可用性较高。


图1. 预印本服务器主页(Home Page of a Preprint Server)


图2. 预印本出版流程(Preprint Publication Process)


图3. 后印本出版流程(Postprint Publication Process)

9、arXiv宣布ChatGPT和类似工具的新政策

  2023 年 1 月 31 日,由于最近发布的生成新文本的人工智能技术在研究界引起了严重的质疑,arXiv宣布了作者使用生成式 AI 语言工具的政策。

  首先,“ChatGPT可以作为研究论文的作者吗?”arXiv管理层和顾问的回答是:“不可以”。例如,计算机程序不能对一篇论文的内容负责,它也不能同意arXiv的条款和条件。

  为了解决这个问题,arXiv针对作者使用生成式AI语言工具采取了一项新政策。全文如下:

  arXiv 意识到科学著作的作者使用各种简单或是复杂的工具来完成他们报告的科研工作,并准备报告本身。同行对此类工具适用性的看法可能多种多样且不断发展;人工智能驱动的语言工具尤其引发了重大争论。我们注意到,工具可能会产生有用和有帮助的结果,但也会产生错误或误导性的结果。因此,了解使用了哪些工具与评估和解释科学作品相关。

  鉴于此,arXiv决定:

  (1)继续要求作者在他们的研究文章中填报任何重要的复杂工具的使用,如仪器和软件;现在特别将文本到文本的生成式人工智能工具包括在应报告的符合方法论主题标准的工具中。

  (2)提醒所有研究人员,只要以论文作者的身份签名,每个人都要对论文的所有内容承担全部责任,无论这些内容是如何产生的。如果生成式人工智能语言工具生成了不恰当的语言、剽窃内容、有错误问题、不正确的引用或误导性的内容,而这些问题包含在科学作品中,则由作者负责。

  (3)生成式人工智能语言工具不应被列为作者;相反,作者应该参考(1)。

10、卫生专业教育预印本:提高认识和转变文化

  预印本有多种好处,包括能够快速交流研究,研究人员有机会获得反馈和提高对其研究的认识,以及广泛和不受限制的访问。然而,2023年1月,贝塞斯达健康科学统一服务大学的Lauren A Maggio教授发文称,尽管有这些好处,但很少有卫生专业教育的文章作为预印本发表,这表明预印本目前还没有被纳入至该学科领域的学术传播文化之中。Lauren A Maggio教授描述了预印本及其好处和相关风险,以及阻碍其在该学科领域中广泛使用的潜在因素,特别是,作者提出了信息传递不一致以及缺乏关于如何存放、批判性评价和使用预印本的正式和非正式教育的障碍。作者认为,为了减少这些障碍,应加强对该专业研究人员的预印本发布、阅读和识别的教育培训,以促进预印本成为卫生专业教育学科领域文化中被接受和鼓励的组成部分,使该领域能够充分利用预印本这一研究传播形式。